国际首个橡胶草高密度SNP遗传图谱出炉 定位了6个含胶量相关QTL

【资料图】

记者3月16日从中国热带农业科学院获悉，该院橡胶所在橡胶草遗传图谱构建和含胶量QTL发掘方面取得重要进展，通过全基因组重测序技术构建了国际上首个橡胶草高密度SNP(单核苷酸多态性)遗传图谱，并结合作图群体的含胶量数据，定位了6个含胶量相关QTL(数量性状位点)。该研究为橡胶草含胶量相关分子标记的开发、分子标记辅助育种和功能基因图位克隆提供了信息基础和技术支持。

研究团队以两个含胶量差异大的橡胶草株系杂交构建的F1代群体作为作图群体，利用“双假测交”策略采用全基因组重测序技术开发SNP标记，基于橡胶草染色体水平上的全基因组信息，成功构建国内外第一个橡胶草高密度SNP遗传图谱。该遗传图谱由12680个bin构建的9个连锁群组成，包含322439个SNP。遗传图谱的总遗传距离为34220.75cM，平均遗传距离2.70cM。结合F1代作图群体的含胶量数据，利用复合区间作图法共检测到6个含胶量相关QTL。其中，在 LG06/ChrA06(第6号连锁群/第6号染色体)上，具有2个最高LOD(Logarithm of odds)值的QTL彼此接近，解释了表型贡献率的48.27%，表明其可能是影响橡胶草含胶量的主要区域，并对该区域包含的基因也进行了初步分析。

天然橡胶是世界四大工业原料之一，巴西三叶橡胶树一直是天然橡胶的主要来源，但由于种植面积限制、生产成本增加、遗传背景狭窄和病虫害严重等因素，橡胶生产逐渐难以满足需求。因此，开发生产天然橡胶的替代资源具有重要的战略意义和经济价值。橡胶草又称俄罗斯蒲公英，其根部橡胶含量高，品质优良，是近年来备受关注的重要产胶作物之一。目前，我国橡胶草种质较少且橡胶草种质的含胶量普遍较低，不能满足橡胶草产业化发展要求。因此，筛选和创制高含胶量橡胶草是目前主要的育种目标。